Appena uscito Il fungo sacro e la croce attirò immediatamente su di sé critiche ostili e scatenò violenti reazioni. Sdegno e indignazione arrivarono dal mondo accademico e dalla Chiesa e la stessa casa editrice che lo aveva pubblicato lo ritirò dal commercio. Attraverso decifrazione di simboli, analisi etimologiche, studi linguistici e indagini filologiche, Allegro dimostra non soltanto che Gesù non è mai esistito, ma che le origini del Cristianesimo e dello stesso Giudaismo sono da ricercare nei culti preistorici del Vicino e Medio Oriente, strettamente legati alla sessualità e all'utilizzo di sostanze psicotrope. Alla base di questi culti misteriosofici, secondo Allegro, ci sarebbe il fungo che, anche grazie alle sue proprietà allucinogene, verrà assimilato alla croce e considerato figlio di Dio. Per la prima volta, nel libro di Allegro, possiamo vedere scientificamente enunciati i fondamenti per credere che la cultura e i linguaggi dell'Oriente e dell'Occidente derivino da una fonte comune, conservata nella primitiva manifestazione storica nei documenti degli antichi Sumeri. Un'occasione per esplorare un audace sentiero sulle origini delle nostre culture e religioni, al di là di ogni dogmatismo e oscurantismo bigotto.